Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms