Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms