Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Samd5Q3V1H9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms