Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc185Q3V118 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc185Q3V118 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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