Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms