Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim80Q3V061 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Trim80Q3V061 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim80Q3V061 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim80Q3V061 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim80Q3V061 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim80Q3V061 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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