Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms