Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms