Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Prdm6Q3UZD5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prdm6Q3UZD5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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