Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms