Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm6899Q3USS0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm6899Q3USS0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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