Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3UPC7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q3UPC7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms