Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc33Q3ULW6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms