Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UJP5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms