Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms