Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Q3U6N9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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