Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud5Q3U2S4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud5Q3U2S4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms