Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms