Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms