Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hhla1Q3TYV2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hhla1Q3TYV2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms