Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms