Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
1700066B19RikQ3TS39 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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1700066B19RikQ3TS39 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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