Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms