Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cul4aQ3TCH7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cul4aQ3TCH7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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