Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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