Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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