Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1aQ2LKU9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1aQ2LKU9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1aQ2LKU9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp1aQ2LKU9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms