Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edem3Q2HXL6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edem3Q2HXL6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms