Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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