Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rpusd3Q14AI6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms