Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms