Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn2bQ0KL01 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms