Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms