Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc21bQ0HA38 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms