Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Calb2Q08331 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms