Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms