Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPINDOCQ05AH6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms