Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms