Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms