Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Top1Q04750 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms