Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms