Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff2Q03404 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms