Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddr1Q03146 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms