Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gjb5Q02739 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms