Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RykQ01887 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RykQ01887 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RykQ01887 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RykQ01887 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RykQ01887 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RykQ01887 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RykQ01887 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RykQ01887 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms