Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VcpQ01853 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms