Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms