Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nme2Q01768 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms