Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mc1rQ01727 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms