Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja5Q01231 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms